μPAD核酸扩增反应多场耦合仿真与优化分析

孙浩1, 熊凌鹄 余勇健 东辉 2
1福州大学
2福州大学
发布日期 2020

基于纸基微流控芯片(μPAD)的核酸提取和扩增反应需均匀稳定、快速响应的热源。半导体制冷器具有无需制冷剂和体积小等优点,可为纸基芯片提供便携式、低功耗分析平台。相较于其他传统核酸扩增与检测设备,μPAD可以借助内部纤维结构的毛细作用自驱动输送流体介质。并且,微尺度下纤维结构具备较高的比表面积,在原理上可改善常规比色、荧光等检测方法的检出限和精准度。然而,滤纸材料本征参数对试剂溶液动态扩散过程和反应结果影响很大,数值仿真模拟是μPAD性能分析和优化设计的重要途径。本文应用COMSOL®热电效应耦合模块和非等温流动耦合模块,获取芯片内部的温度场信息,评价μPAD温控系统设计;应用多孔介质稀物质传递模块,获取纸基孔隙率、平均孔径、厚度、通道宽度等参数对加热区溶质输运时间的定量影响。保证核酸扩增区具备反应温度条件的同时,选取最适宜的工作电压;并且,保证该区域溶液浓度满足扩增需求的同时,选取最合适的基体材料。分析结果表明,选用孔隙致密滤纸时浓度扩散较慢,而增加通道截面积则对溶液沿通道扩散速度有阻碍。本研究验证了应用μPAD进行空域环介导等温扩增反应(Spatial LAMP)的可行性,完成了芯片布局优化设计与性能评价。

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