通过仿真指导 mRNA 疫苗生产

2023年 8月 10日

脂质纳米粒(LNP)递送技术被用于病毒疫苗、癌症疗法、镇痛剂和光动力疗法等各种药物应用中。近年来,LNP 技术在 mRNA 疫苗中的应用尤其受到公众的关注。mRNA 疫苗的递送效果取决于 LNP 的尺寸和剂量:小尺寸 LNP 更善于穿透组织,但由于递送产量低,需要较高的剂量。研究人员可以通过反复实验来满足这些要求。然而,来自 Veryst Engineering 的一个研究团队提出,通过仿真指导设计过程将对实验起到补充作用,最终可以节省成本和时间,帮助找到更具创新性的解决方案。

mRNA 疫苗生产:混合与自组装

Veryst Engineering 是一家工程咨询公司,专注于通过仿真进行产品设计、制造工艺和疲劳分析。在 COMSOL 主题日:制药应用的主题演讲中,Veryst 的合伙人 Matthew Hancock 和高级工程师 Joseph Barakak 介绍了 mRNA 疫苗的生产,并分享了如何通过仿真提升纳米药物的设计过程。

“广义上来说,mRNA 疫苗生产是有机相与水相的混合。水相中含有带负电荷的 mRNA,有机相中含有用于封装 mRNA 的脂质。”Barakat 介绍说,“只要有足够的停留和混合时间,这些成分就会混合并进行自组装,自发形成聚集体。这些聚集体,即 LNP 构成了近年来备受公众关注的 mRNA 疫苗。”

示意图显示了 mRNA 疫苗是如何生产的。
图1.mRNA 疫苗的详细生产示意图。图片由 Veryst Engineering 提供。

Barakak 解释说,有两种常见的方法可以将各种成分混合在一起形成聚集体。在大规模的药物生产制造中,使用湍流方式,即通过大漩涡分解成越来越小的漩涡的级联快速混合提高分子扩散的效果。对于小批量药物生产,如药物发明或精准医学开发中,则采用微流控设备,因为它的流体体积小。“微流控设备面临的挑战是……,要实现高效、快速的混合,就不能利用湍流混合,但湍流混合又非常高效。” Barakak 说道。此外,即使这种设备很小,分子扩散速度通常来说也仍然太慢,无法达到理想的混合速度。不过,有多种主动和被动形式的混合,包括混沌混合都适合用于微流控设备。

首先且重要的是,要理解哪种混合方式最适合生产 mRNA 疫苗。在生产疫苗时,还需要克服更多的挑战。

LNP 生产面临的挑战

生产 mRNA 疫苗是一项艰巨的任务。LNP 的尺寸(直接影响这些纳米药物的疗效)在很大程度上取决于混合时间。Hancock 说:“一般来说,混合时间越长,脂质聚集的时间就越长,从而产生更大的聚集体和更不均匀的尺寸分布;而混合时间越短,纳米颗粒越小,但产量越低。

2 种 mRNA 疫苗的照片
图2.两种瓶装 mRNA 疫苗。照片由 Spencer Davis 拍摄,来自 Unsplash

可以通过反复实验实现混合时间的微调,但生产和测试实际装置既费时又费钱。仿真可以补充和完善小批量和大规模生产过程中的实验设计过程。在主题演讲中,Veryst 举例说明了如何利用仿真比较不同的微流体设备设计,通过几何特性实现混沌混合。

微流控设备中的混沌混合

在主题演讲中,Hancock 简要介绍了三种微流体设备设计的混合仿真预测,据报道,这三种设计已经用于真实的实验中来生产 LNP。在每种设计中,装载着脂质的乙醇从一个入口流出,装载着 mRNA 分子的水则从另一个入口流出。当两种流体汇合后再一起流过每个设备。理想情况下,所有三种设备设计都能使乙醇和水充分混合,并使各组分沿途自组装成 LNP。沿通道连续横截面的流线和乙醇浓度预测显示了这一过程混合成功(图3-5)。

型号1:蛇形混合器

在第一个模型(图3)中,Hancock 分析了一个采用蛇形设计的微流体设备。Hancock 说:“微流控蛇形混合器通过蛇形通道产生的涡流实现了高效的混沌混合。”该设备的通道高度为 100µm,这是微流控设备的典型特征。

在这种设计中,当流速较高(雷诺数为 20-100 )时,乙醇和水在蛇形通道的末端完全混合,这对于 LNP 的形成和 mRNA 疫苗的生产都是非常理想的。图3中的图像显示了“乙醇浓度在通道横截面上的分布,并显示了混合是如何沿着通道逐步进行的。”Hancock 说道。遗憾的是,在流速较低时,这种设备无法产生良好的混合和高效 LNP 生产所需的漩涡和惯性效应。

采用蛇形搅拌器设计的微流体设备的模型。
图3. 采用蛇形搅拌器设计的微流体设备的流线和通道横截面上的乙醇浓度。图片由 Veryst Engineering 提供。

型号 2:交错人字形搅拌器

第二个模型(图4)是一台交错人字形搅拌器。“这是一种人们一看到就会记住的搅拌器。” Hancock 介绍道,这种设计由 “人字形凹槽组成,这些凹槽沿着通道底部交替排列,使流线形成一种膛线”。

凹槽的交替方向促进了通道内物体的面包师变换(Baker’s transformation)。或者,正如 Hancock 所解释的那样:“它将最初大量的两种不同溶液拆分并重新组合,逐渐产生越来越多和距离越来越近的单个溶液交替层”。随着两种溶液层的距离越来越近,它们在分子扩散过程中的混合速度也越来越快。人字形搅拌器可提供跨流速的有效混合,这意味着它没有蛇形设计的高流速限制。

“事实证明,这种特殊类型的混合器在很宽的流速和雷诺数范围内都很高效。”Hancock 说道。该模型的预测表明,人字形混合器应能够高效生产 LNP 和 mRNA 疫苗。

采用交错人字形混合器设计的微流体设备的模型。
图4.采用交错人字形混合器设计的微流体设备的流线和通道横截面上的乙醇浓度。图片由 Veryst Engineering 提供。

模型3:环形混合器

主题演讲中讨论的最后一个模型是由一系列环形通道组成的微流体混合器。Hancock 说:“(这种)微流体混沌混合器使用的是迪恩流。迪恩流是流体在弯曲通道中运动时形成的一种循环,它在流速和雷诺数较高时非常活跃”。

在该模型的模拟中,流体的混合相对成功,但与蛇形方法一样,该混合需要较高的雷诺数。Hancock 还注意到,尽管通过每个环后的混合程度有所改善,但图中的设计(图5)需要更多的环才能产生理想的混合效果。

采用环形混合器设计的微流控设备的模型。
图5.采用环形混合器设计的微流控设备中,沿通道横截面的流线和乙醇浓度。

将仿真与实验相结合,实现更快、更好的设计

通过仿真,Barakat 和 Hancock 能够测试不同微流体混沌混合器设计的有效性,并优化通常缓慢的微流体混合过程。理想情况下,在制造实验混合器原型之前 就开始进行这种仿真和设计优化。在制造原型之前进行仿真,可以提高原型良好运行的可能性,减少需要制造的原型数量,从而节省时间和成本。在文中介绍的工作中,仿真表明环形混合器的设计应包括更多的环,以及混合性能如何取决于流速和雷诺数等运行参数流。为了生产 LNP 和 mRNA 疫苗,需要在实验室进行实验来测试每种混合器设计中形成的 LNP 的尺寸和分布,然后将其与混合指标相关联。

就像 Barakat 和 Hancock 在整个演讲中所展示的那样,流动、传递和 LNP 自组装的多物理场仿真可用于:

  • 增强对 LNP 形成的流动和动力学限制的理解
  • 将关键成果与系统参数相关联
  • 对有意义的中间量和最终量(如混合时间和种群数量分布)进行定量估算
  • 减少昂贵的实验室实验次数,提高每次实验的价值
  • 指导迭代路径设计,提供新的药物开发路径

“我们已经证明,在微流控设备中可以实现有效的混合。仿真可以帮助调整设计参数,在制造和测试之前优化性能。”Hancock 说道。

下一步

观看 Veryst Engineering 的主题演讲视频,了解有关微流控设备中混沌混合的更多信息,查看他们如何模拟 mRNA 疫苗生产过程中的耦合混合和 LNP 自组装。

关于 Veryst 工程公司

Veryst Engineering, LLC 在技术与制造的交界处提供优质的工程咨询服务。他们的目标是成为多物理场仿真、材料科学、失效分析以及材料建模和测试领域的全球翘楚,并经常将其应用于非线性、耦合问题,从而使客户能够为其客户提供最好的产品。他们帮助世界各地的客户优化产品设计、改进制造工艺和诊断产品问题。


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